Nedílnou součástí současných geodetických přístrojů se stal jejich vnitřní software. Jeho prostřednictvím je dnes možné vykonávat většinu základních geodetických činností jako je měření, vytyčování apod. Jednotlivé aplikace se liší svojí vybaveností a v závislosti na použitém opearčním systému i způsobem svého ovládání. Nejnovějším krokem ve vývoji tohoto specifického software je využívání moderního operačního systému Windows.CE, který posunul ovládání geodetických přístrojů (totálních stanic) na dříve ani netušenou úroveň.